نکات پیپت فیلتر شده نقش مهمی در بسیاری از زمینه های تجربی مانند زیست شناسی مدرن، شیمی و پزشکی ایفا می کند. انتخاب اندازه منافذ آن ارتباط مستقیمی با کیفیت نمونه های آزمایشی، دقت نتایج تجربی و تکرارپذیری آزمایش ها دارد.
اول از همه، اندازه منافذ بر اثر فیلتر ناخالصی در نمونه تأثیر می گذارد. اگر اندازه منافذ بیش از حد بزرگ باشد، برخی از ذرات ناخالصی ریز مانند بقایای سلولی، ذرات گرد و غبار یا مواد حل نشده ممکن است در طول فرآیند پیپت کردن وارد نمونه شوند. این ناخالصی ها ممکن است با واکنش تجربی تداخل داشته باشند. به عنوان مثال، در آزمایش های کشت سلولی، ناخالصی ها ممکن است به سطح سلول بچسبند، رشد طبیعی و متابولیسم سلول ها را تحت تاثیر قرار دهند و باعث انحراف در داده های تجربی شوند. در مقابل، اگر اندازه منافذ خیلی کوچک باشد، اگرچه میتواند ناخالصیها را به طور مؤثرتری رهگیری کند، ممکن است اجزای هدف را در نمونه جذب کند، بهویژه برخی از ماکرومولکولها مانند پروتئینها، اسیدهای نوکلئیک و غیره. این امر منجر به کاهش غلظت نمونه و همچنین نتایج تجربی را نادرست می کند.
برای انواع مختلف نمونه های آزمایشی، اندازه منافذ مناسب نیز متفاوت است. هنگام برخورد با سوسپانسیون های سلولی، معمولاً لازم است اندازه منافذی انتخاب شود که بتواند بقایای سلولی را بدون آسیب رساندن به سلول ها به طور موثر فیلتر کند. به طور کلی، اندازه منافذ 0.2 - 0.45 میکرون بیشتر مورد استفاده قرار می گیرد. این محدوده اندازه منافذ میتواند اکثر ناخالصیها مانند بقایای سلولی و باکتریها را مسدود کند و از خلوص و فعالیت سلولها در حین پیپت کردن اطمینان حاصل کند. هنگام انجام آزمایش های استخراج اسید نوکلئیک، به منظور جلوگیری از شکستن DNA ژنومی و اطمینان از یکپارچگی RNA، انتخاب اندازه منافذ فیلتر باید با احتیاط بیشتری انجام شود. معمولاً اندازه منافذی در حدود 0.2 میکرون انتخاب می شود که نه تنها می تواند ناخالصی های احتمالی را حذف کند، بلکه نیروی برشی روی مولکول های اسید نوکلئیک را نیز به حداقل می رساند.
علاوه بر این، اندازه منافذ فیلتر نیز بر دقت و صافی پیپتینگ تأثیر می گذارد. اندازه منافذ خیلی کوچک ممکن است مقاومت مایع را در هنگام عبور افزایش دهد و در نتیجه سرعت لولهگذاری کندتر و حتی باقیمانده مایع ایجاد شود. این نه تنها کارایی آزمایش را کاهش می دهد، بلکه ممکن است به دلیل حجم نادرست پیپتینگ، نتایج آزمایش را نیز تحت تأثیر قرار دهد. اندازه منافذ فیلتر مناسب می تواند اطمینان حاصل کند که مایع در طول فرآیند پیپت کردن به آرامی از نوک پیپت عبور می کند و دقت و تکرارپذیری پیپت را بهبود می بخشد.